Program unggulan Ponpes Amal Jama'i terdiri dari enam bidang pembinaan utama, yakni pembinaan Tahsin Tahfidz Al Qur'an bersanad, pembinaan Bahasa Arab, pembinaan kepesantrenan, pembinaan Pendidikan Formal, pendidikan pengasuhan, dan pengembangan diri.
Pembinaan Al Qur'an
Yang diunggulkan dalam pembinaan Al Qur'an di ponpes Amal Jama'i adalah pembinaan al Qur'an yang bersanad, baik program tahsin maupun tahfidz.
Program bersanad ini kami angkat mengingat alhamdulillah pimpinan ponpes Amal Jama'i yakni Ust Abdul Latif Alhafidz adalah seorang Qori dan Hafidz yang mewarisi sanad Qiro'ah Sab'ah dan khusus Qiro'ah Ashim riwayat Hafs beliau bertakhossus dan terus mendalaminya hingga saat ini sudah memiliki empat jalur sanad.
Para guru juga setiap hari memiliki jadwal khusus untuk bertalaqqi menerima pembinaan bersama Ust Abdul Latif sehingga dengan cara ini diharapkan pengajaran yang dilakukan para guru juga memiliki standar periwayatan yang jelas untuk setiap ayat, surat, atau bacaan yang ditalqinkan kepada para santri.
Pembinaan Bahasa Arab
Pembinaan bahasa Arab di Ponpes Amal Jama'i diketuai oleh Ust Abdul Fatah Alhafidz seorang dosen dari Ma'had STIBA Ar Raayah yang tidak diragukan lagi kemampuannya dalam berbahasa arab. Ust Abdul Fatah juga merekrut tim pembinaan bahasa dari rekan-rekannya para dosen STIBA Ar Raayah sehingga insyaallah dalam pembinaan Bahasa Arab ini diyakini mampu memberikan kualitas pengajaran yang dapat diunggulkan.
Pembinaan Kepesantrenan
Pembinaan kepesantrenan di Ponpes Amal Jama'i memiliki visi membekali para santri untuk agar memiliki pemahaman dasar islam yang kuat. Juga agar para santri mengilmui segala hal yang dilakukannya setiap hari sebagaimana perkataan ulama bahwa ilmu harus mendasari setiap perkataan dan perbuatan.
Pembinaan kepesantrenan yang diberikan kepada santri mencakup pembinaan Akidah, Fikih, Akhlak, Hadits, dan juga Sejarah Islam.
Dengan empat pilar pembinaan kepesantrenan ini diharapkan para santri menjadi generasi yang shalih, mushlih juga aaliim.
Pembinaan Akademik Formal
Pembinaan akademik formal dimaksudkan agar para santri juga tidak ketinggalan dari sisi pendidikan formal, memiliki rapot, juga ijazah di akhir masa studinya.
Pendidikan formal di ponpes Amal Jama'i saat ini hanya tersedia untuk jenjang pendidikan SMP/MTs dan SMA/MA.
Pembinaan Pengasuhan
Pembinaan pengasuhan adalah bentuk pengelolaan kegiatan para santri 24 jam juga proses pendampingannya. Untuk program pengasuhan ini para santri memilki jadwal sebagai berikut:
03.00-04.00 Qiyamullail
04.00-04.45 Rangkaian Shalat Subuh dan dzikir Pagi
04.45-06.15 Halaqoh Al Qur’an
06.15-06.30 Shalat Isyroq
06.30-08.00 Piket kebersihan, mandi, dan sarapan
08.00-10.00 Halaqoh Al Qur’an
10.00-10.30 Istirahat
10.30-11.45 Kajian materi dasar keislaman
11.45-12.30 Rangkaian Shalat Dzuhur dan Kultum Santri
12.30-13.00 Tilawah Al Qur’an/Muroja’ah
13.00-15.00 Makan siang dan istirahat
15.00-16.00 Rangkaian Shalat Ashar dan dzikir petang
16.00-17.15 Halaqoh Al Qur’an
17.15-18.00 Makan sore dan mandi
18.00-18.45 Rangkaian Shalat Magrib
18.45-19.45 Halaqoh Al Qur’an
19.45-20.15 Rangkaian Shalat Isya
20.15-20.45 Tilawah Al Qur’an/Murojaah
20.45-21.30 Istirahat dan persiapan tidur
21.30-03.00 Tidur
Pembinaan Pengembangan Diri
Program pengembangan diri yang sudah berjalan saat ini adalah pembinaan Organisasi Santri / OSIS. Dengan berorganisasi para santri dapat belajar mengemban tanggung jawab juga memiliki kapasitas manajemen untuk banyak hal.
Terkait program ekstrakurikuler saat ini sudah mulai berjalan hanya tidak intensif lebih ke sesuai minat / keluangan waktu para santri. Jadwal kegiatan pesantren yang padat dari senin hingga sabtu membuat para santri cukup lelah jika di sisa waktu mereka masih harus secara intensif mengikuti ekstrakurikuler. Sehingga terkait ekstrakurikuler di ponpes Amal Jama'i sistemnya lebih fleksibel sesuai minat dan keluangan waktu para santri.
